什么是UpSet图？
可以说是Venn图的变体，对于集合数据的可视化，适用于少量组别的数据集，一般用于转录组数据基因交集分析，而我最近在分析不同组别的代谢组数据的时候发现同理，下面以我自己数据为例，效果图如下：
UpSet图在线分析网站
我这里直接用的是联川生物云平台，云工具-搜索-UpSet图
下载官方示例文件准备数据
列名是基因名称（那我的示例中就是代谢物名称），行名是样品分组名称，该样品检测到了列名，对应位置就标记为“1”，否则为“0”，具体整理见下方数据准备
数据准备
- 网站有具体的视频教程，但简而言之就是所有组别鉴定到的物质名称并集作为一列，各组别包含这个物质就记为1，没有就记为0，下面进行示例：我要制作Rumen、Serum和Milk当中鉴定到的差异代谢物的Upset图
- A列是Rumen、Serum和Milk当中鉴定到的差异代谢物的并集，F/G/H是Rumen、Serum和Milk分别鉴定到的差异代谢物，现在目标是若F列和A
n列有重合的数据，在Bn列就标记“1”，比如查找A2的(+/-)12(13)-DiHOME这个，物质是否在Rumen中存在，使用公式=IF(COUNTIF(F:F,A2)=0,"1","0")，同列下拉即可（更多求两列之间重复数据的公式可以参考 Excel表格中两列数据对比，找出异同的数据）
- 都查找得到数据后，复制B/C/D后重新粘贴，选择
仅粘贴数值，删除F/G/H列，即可保存上传网站进行分析
生成结果图与调整
不过多赘述，左侧参数调整区域可以设置字号、图形大小、坐标轴等，右侧支持导出PNG/PDF/SVG/TIFF等多种格式，可调整图片大小，并可以下载交集数据，效果在题头已经给出，更多可以自行摸索
本文作者：
twocanis
本文链接： https://twocanis.github.io/2023/03/26/%E4%BB%A3%E8%B0%A2%E7%BB%84%E5%AD%A6%E7%BB%93%E6%9E%9C%E5%9C%A8%E7%BA%BF%E5%88%86%E6%9E%90%EF%BC%9A%E4%B8%8D%E5%90%8C%E7%BB%84%E5%B7%AE%E5%BC%82%E4%BB%A3%E8%B0%A2%E7%89%A9%E9%AB%98%E7%BA%A7%E9%9F%A6%E6%81%A9%E5%9B%BEVenn%E7%9A%84%E7%BB%98%E5%88%B6%E2%80%94%E2%80%94UpSet%E5%9B%BE/
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