写在前面
因为公司给的PCA结果效果不佳,决定从中重新挑选部分样本进行再分析
步骤
表格结果预处理
- 在属水平genus参考原本结果已有的PCA图,尽可能挑选距离较远且聚团的样本
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- 选取不同样本属水平的丰度数据,整理成逗号分隔的csv文件
代码演示
1 | library(vegan) # 计算bray距离 |
结果展示
![image-20230720091632805](https://raw.githubusercontent.com/twocanis/blog-img/main/image-20230720091632805.png)
本文作者:
twocanis
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