写在前面
需求是返回的结果每组样本数量比较多,但组间差异不明显,挑出来重分析。详情请参考 [组间差异分析:Anosim]([组间差异分析:Anosim - 知乎 (zhihu.com)), 当然亲测更简便的方法可以借助云平台工具:
步骤
表格准备
- 不同样本属水平的丰度表
- 分组信息表
云平台分析
- 上传云平台
- 结果分析与下载,这个很快
- 调整:pdf格式拖进AI里改色
结果解读
图形解读:盒型图纵轴表示距离排名,横轴between表示组间距离,其他表示对应分组组内距离。R值表示组间与组内的差异程度。R的范围为[-1,1]。R<0组间差异小于组内差异;R>0组间差异大于组内差异;R=0组间差异等于组内差异。
盒型图参数解释:
N:样本数;
Median:中位数
Q3:上四分位数
Q1:下四分位数
IOR:四分位距,interquartile range,即Q3-Q1
max:Q3+1.5IQR范围内的最大值
min:Q1-1.5IOR范围内的最小值
outlier:异常值/离群值,即小于Q1-1.5IOR或Q3+1.5IQR的值
notch:中位数95%置信区间(confidence intervals)的范围
本文作者:
twocanis
本文链接: https://twocanis.github.io/2023/09/17/%E5%9F%BA%E4%BA%8ER%E5%81%9A%E7%BB%84%E9%97%B4%E5%B7%AE%E5%BC%82Anosim%E5%88%86%E6%9E%90/
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