前言

前两天画KEGG的分类图师兄路过看到了让帮也画一个，一问是两个分组，于是建议参考这篇 Multi-omics reveals that the rumen microbiome and its metabolome together with the host metabolome contribute to individualized dairy cow performance 画差异代谢物的HMDB（KEGG）图就行，还能标出fold change值，简洁明了

前言

刚入学的时候装机软件一起下载了XMind，后来只是在组会文献精读做大纲的时候用过几次，生疏得很，今天做年终总结的大纲发现能够将做好的导图导出为markdown格式，也能将markdown格式直接导入生成导图，这样给常用md做实验记录和日常笔记的我带来了诸多便利（尽管这点早就写在了官方教程和各大推荐里，是我没有好好了解-_-)

前言

整理实验数据，进行可视化，旭日图有利于简洁明了的展示多层次结构

数据准备工作

• 对公司返回回来的代谢组结果进行整理，在MSMS二级质谱结果中找到需要分析组别的csv格式文件，直接用excel打开（p值过滤后的数据）

• 在总表的结果文件中找到全部物质的KEGG信息和HMDB信息

背景

基于公司已给出的结果上做出调整（公司只给出了top10），画KEGG富集通路的气泡图，初始文件如下图

问题描述

基于hexo新搭建好的个人博客想更换网页图标的icon

期望达到的效果

更换前：

更换后：

MetaboAnalyst 5.0

MetaboAnalyst 5.0

可进行代谢组数据的可视化分析，Module Overview如下，包括Biomarker Analysis/ Enrichment Analysis/Pathway Analysis/Joint Pathway Analysis/Network Analysis以及各种封图分析等，基本送测公司的报告里头的结果图，只要拿到excel检测结果信息表都能在这个网站自己做，操作简单直接上手

写在前面

本文参考手把手教你从0开始搭建自己的个人博客 |无坑版视频教程| hexo
相当于是自己的实操练习

推荐主题

yilia

写在前面

​ 刚搭的这个个人blog站，肯定会要用到markdown，就干脆把之前写的笔记拿上来，因为是刚接触的时候写的，现在看起来还是挺可爱的，没改动直接放上来了，有问题再改

​ 刚开始接触markdown，因为自己是纯科研狗，仅仅只是想找个工具做实验记录方便点，于是先尝试了vscode 中的markdown编辑器，先熟悉了基本的语法，确实这种零排版的格式整洁漂亮，但还是有不少问题，比如图片的粘贴（即使下了插件也不太好用），表格的绘制以及文本内容的粘贴和导出等，文本只能保持markdown格式粘贴出去，没法去掉格式。于是我自己就找了一下更方便一点的本地markdown编辑器，意外找到了typora，初步尝试了一下，很惊喜，上手不要太爽，自己也只是个新手，想到可能没人比我还傻需要如此简单的教程，所以就权当给自己列个说明了自己看了，所以用Typora写了这个，如下。

• hexo n "file" blog文件夹下新建file.md文件
• hexo g generation，可理解为更新文件
• hexo d deploy，部署
• ctrl+C，退出hexo

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写在之前：

本文参考

手把手教你从0开始搭建自己的个人博客 |无坑版视频教程| hexo

hexo搭建个人博客（一）
hexo搭建个人博客（二）

具体的步骤上面的视频和文章已经写得很详细了，但因为我这里是windows系统，遇到了和上面不一样的问题，包括